Die Berliner Brücke befindet sich zwischen der Berliner Straße, Maximilianallee, Mockauer Straße und Rackwitzer Straße. Die Gleisanlagen liegen zwischen dem Nordfriedhof und der ehemaligen Leipziger Wollkämmerei. Südlich des Bauwerks liegen die Zufahrten zum Leipziger Hauptbahnhof und der ICE-Werkstatt sowie nördlich der neue Haltepunkt "Leipzig Nord / Berliner Brücke".